Если wuauclt.exe присутствует в списке процессов, значит обновляется. У меня было что-то наподобие, до тех пор, пока я не отключил автоматическую службу обновления(она по умолчанию включена) и не отключил слежение за её исполнением в брандмаузере. Правда, можно другим способом избавиться от проблемы - довесить пару гига ОЗУ.